Scherzetto maligno di Malwarebytes

e allora reinstalla tutti i programmi. Però se è il SO che ha dei file mancanti, dovrai formattare lo stesso.
Sicuramente è un programma che si avvia all'accensione, quindi devi controllare il menu avvio e vedere cosa hai in partenza automatica. Se sei fortunato è magari uno dei programmi installati da te visibili dell'avvio, e deselezionandoli a uno a uno puoi verificare quale di essi era (non compare più il popup).
Però il software "quadratini" mi sa di roba cinese... può essere un indizio?